主要原因是胃内容物反流刺激食管黏膜，反流物中引起刺激的主要成分是胃酸与胃蛋白酶，也可包括胆汁。少数烧心患者缺乏食管组织结构性和动力障碍性疾病证据，被称为功能性烧心，与内脏敏感性增加有关。烧心是胃食管反流病的主要症状，其处理原则与后者相同。