通过检测子宫颈脱落细胞中高危型人乳头状瘤病毒（HR HPV）来预测子宫颈高级别上皮内病变及子宫颈癌风险的方法。
HPV感染是女性下生殖道常见的病毒性感染。70%～80%的女性在其一生中至少发生过1次HPV感染，特别是年轻及性活跃者，感染率最高，而随年龄增长，感染率也降低。已经发现的HPV有200多种基因型，与宫颈高级别上皮内病变及宫颈癌相关的HPV型别称为高危型，包括HPV16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59（Ⅰ类证据：证据来自至少一项设计良好的随机对照临床试验）及66、68（Ⅱ类证据：证据来自非随机临床评估），其中HPV16及18是最强的致癌病毒类型，在宫颈癌患者中分别占50%～60%和10%～20%，其他10余种高危型HPV约导致30%的宫颈癌。
常用的HPV检测技术有杂交捕获、聚合酶链反应（PCR）和酶切信号放大等。检测目标是病毒DNA或mRNA。国际上关于宫颈癌筛查的HPV检测方法的要求包括：可接受的重复性、临床敏感性、特异性、阳性预测值及阴性预测值，其检测宫颈高级别及以上病变的敏感性需达到90%以上，这样才能达到最大化筛查的益处和最小化筛查的潜在危害。
由于HPV在年轻女性中的高感染率，此年龄段中，HPV检测在预测子宫颈高级别上皮内病变及子宫颈癌的阳性预测值过低，故HPV检测仅限于25岁及以上女性。HPV检测在子宫颈癌筛查中可用于以下三个方面：
①与细胞学联合初筛。对年龄在30～65岁者进行每5年1次的细胞学和HPV的联合筛查。联合筛查结果阴性者5年内发生高级别及以上病变风险极低。对于HPV阳性者，依据不同细胞学结果做不同处理：细胞学结果正常，可接受1年后联合筛查或HPV16/18基因分型，如HPV16/18阳性，推荐阴道镜检查；细胞学≥无明确意义的非典型鳞状细胞（ASC－US），推荐阴道镜检查。对HPV阴性者，如细胞学为ASC－US，推荐3年后复查；如细胞学≥低度鳞状上皮内病变（LSIL）者，推荐阴道镜检查（其中LSIL＋HPV阴性者采用1年后联合筛查是首选的，选择阴道镜检查是可接受的）。
②初筛。HPV检测阴性3年或5年后筛查。HPV检测阳性，细胞学分流，细胞学为≥ASC－US，推荐阴道镜检查；如果HPV16/18阳性，推荐阴道镜检查。
③用于轻度异常细胞学的分流：对于细胞学初筛发现的ASC－US，可用HPV检测来分流，如果HPV阳性，推荐阴道镜检查；如果阴性，3年后筛查。