伴有身体其他器官遗传性疾病（如眼、神经系统、骨骼系统、泌尿系统、内分泌系统、皮肤以及代谢性疾病等）的遗传性耳聋。临床上，根据受累器官和病变部位的不同有各种综合征。据统计，综合征性耳聋约有400种，约占遗传性感音神经性聋的30%，已明确的综合征性耳聋基因超过150个。
有较高的临床及遗传异质性，在遗传性聋中发病率相对较低。全身病变的临床表现变化多样，除听力障碍外同时伴有眼、骨、肾、皮肤、神经系统、内分泌系统等其他器官或系统异常，对病患生存质量影响较大。其中较为常见且致病基因比较明确的综合征包括：
①常染色体显性遗传。瓦登伯革（Waardenburg）综合征（PAX3、MITF、SOX10、EDN3等基因）、BOR综合征（EYA1、SIX1等基因）、特雷彻·柯林斯（Treacher Collins）综合征（TCOF基因）等。
②常染色体隐性遗传。潘特林（Pendred）综合征（SLC26A4等基因）、乌舍尔（Usher）综合征（MYO7A、CDH23、USH3A等基因）等。
③性连锁遗传。Norrie病（NDP基因）、阿尔波特（Alport）综合征（COL4A5/6、COL4A3、COL4A4等基因）。
④线粒体母系遗传。MERRF综合征、MELAS综合征、皮尔逊（Pearson）综合征、卡恩斯-赛尔（Kearns–Sayre）综合征和母系遗传性糖尿病一耳聋综合征等。
对于临床表型和致病基因明确的综合征性耳聋，可以通过有针对性的基因筛查技术完成明确诊断。某些综合征性聋，如Waardenburg综合征和前庭导水管扩大综合征，临床表型和致病基因已经比较明确。特异性地针对临床表型和致病基因明确的综合征性聋开发新的检测技术，耳聋基因明确诊断后，根据先证者及其双亲携带基因类型，结合相应的遗传方式，提供准确的遗传咨询及产前干预，以减少耳聋出生缺陷。对于出生后的新生儿进行听力和耳聋基因联合筛查，选择有效的干预手段和言语康复，对于隐匿性或迟发性损伤也可早期采取干预措施。