婴儿出生后因不利的环境因素导致免疫系统出现暂时性的功能障碍。
一旦不利因素被纠正，免疫功能即可恢复正常。引起继发性免疫功能低下的常见因素，各种维生素和微量元素缺乏引起的免疫功能缺陷。
| 营养紊乱 | 蛋白质-热能营养不良，铁缺乏症，锌缺乏症，维生素A缺乏症，肥胖症 |
| 免疫抑制剂 | 放射线，抗体，糖皮质激素，环孢菌素，细胞毒性药物，抗惊厥药物 |
| 遗传性疾病 | 染色体异常，染色体不稳定综合征，酶缺陷，血红蛋白病，张力性肌萎缩症，先天性无脾症，骨骼发育不良 |
| 肿瘤和血液病 | 组织细胞增生症，类肉瘤病，淋巴系统肿瘤，白血病，霍奇金淋巴瘤，淋巴组织增生性疾病，再生障碍性贫血 |
| 新生儿 | 免疫系统和免疫反应处于一个特殊阶段，胎儿在宫内的封闭环境中未受到抗原刺激，母体免疫功能和分娩过程对新生儿免疫功能的影响等因素，均致使新生儿期出现生理性、暂时性免疫功能低下 |
| 感染 | 细菌感染，真菌感染，病毒感染（包括HIV等），寄生虫感染 |
| 其他 | 糖尿病，蛋白质丢失性肠病，肾病综合征，尿毒症，外科手术和外伤 |
| 免疫功能缺陷 | ||||
| 营养素缺乏 | T细胞 | B细胞 | 巨噬细胞 | 中性粒细胞 |
| 维生素A | +++ | +++ | ||
| 维生素B1 | ++ | |||
| 维生素B2 | ++ | |||
| 维生素B6 | +++ | +++ | ||
| 维生素B12 | ++ | + | ++ | |
| 生物素 | +++ | |||
| 泛酸 | +++ | |||
| 叶酸 | ++ | +++ | ||
| 维生素C | ++ | ++ | ||
| 维生素D | ++ | |||
| 维生素E | ++ | ++ | ++ | |
| 烟酸 | ++ | |||
| 锌 | +++ | + | ||
| 铁 | +++ | + | +++ | |
| 铜 | *+ | *++ | *++ | |
| 镁 | *+ | |||
| 硒 | ++ | ++ | ||
| +：轻度抑制，++：中度抑制，+++：严重抑制，*：动物模型结果，尚未在人体证实 | ||||