临床主要指奈瑟菌感染（包括脑膜炎奈瑟菌、淋病奈瑟菌、金黄奈瑟菌、干燥奈瑟菌等）、卡他莫拉菌感染等。
脑膜炎奈瑟氏菌引起的化脓性脑膜炎，简称流脑。由呼吸道传播，冬春季多发，儿童易感。病原菌由鼻咽部侵入血循环，引起菌血症和败血症而有发热、毒血症症状及皮肤黏膜瘀点瘀斑，最后局限于脑膜及脊髓膜引起化脓性炎症。淋病是由淋病奈瑟菌通过性交传染的一种泌尿生殖道炎症。卡他莫拉菌不仅可以引起儿童和老年人的上呼吸道感染，而且是引起成人下呼吸道感染的重要病原菌，是儿童上颌窦炎、中耳炎、肺炎以及成人的慢性下呼吸道感染的第三位常见致病菌，仅次于流感嗜血杆菌和肺炎链球菌，尤其多见于慢性阻塞性肺病患者。