诊断系统性红斑狼疮（SLE）的标记抗体之一。简称抗ds-DNA抗体，又称抗天然DNA抗体。
多出现在SLE的活动期。抗双链DNA抗体的滴度和疾病的活动密切相关。
抗双链DNA抗体是抗DNA抗体中的一种。其反应位点位于DNA脱氧核糖磷酸框架上。抗双链DNA主要出现于SLE患者的血清中，对SLE患者的组织器官损伤有致病作用。在SLE患者血循环中，大分子的DNA浓度显著高于正常人，DNA还可与多种器官的微血管结构包括肾小球基底膜上的硫酸乙酰肝素（heparansulfate）结合，抗双链DNA抗体可与这些循环中的和器官原位的DNA分子反应，形成抗原抗体复合物，激活炎症系统如补体活化途径，导致组织损伤。也有人认为，致病性抗DNA抗体在肾脏中的沉积并非只取决于抗DNA抗体与DNA的结合，而是通过与基底膜上硫酸乙酰肝素、层黏连蛋白（laminin）、心磷脂等非DNA抗原的交叉反应或静电引力作用固定于肾脏，诱导炎症反应。抗DNA自身抗体中有的有致病性，有的没有致病性。致病性的抗DNA抗体具有以下特性：亲和性高，能与补体结合，能结合双链DNA（dsDNA），带正电荷，多反应性，为免疫球蛋白G（IgG）类。抗DNA抗体能穿入活的淋巴细胞，干扰细胞功能，引起细胞凋亡，抗ds-DNA抗体也能进入肾小球膜细胞，引起肾小球细胞增殖，促细胞融合和蛋白尿形成。这可能是致病性抗DNA抗体的另一特征。
临床意义
正常值
绿蝇短膜虫法：健康人血清1∶10稀释为阴性。放射免疫分析法Farr试验：健康人结合率≤20%。酶联免疫吸附试验（ELISA）：一般以待测血清A值/阴性对照A值（P/N）≥2.1为阳性，正常人P/N值＜2.1（ELISA法）。滴金免疫渗滤试验：正常人为阴性（NC膜上不出现着色点）。
异常结果
抗双链DNA自身抗体是SLE的最重要的自身抗体，检出率40%～70%。高滴度抗双链DNA的存在是SLE诊断的重要依据，也是疾病活动性特别是肾脏损伤的标志。除用于SLE的诊断外，也可用于临床病程和治疗效果的监测，对判断预后也有一定价值。但也有人报道在肝脏疾病、青少年型类风湿性关节炎，乃至正常人中发现低滴度抗双链DNA阳性或增高：可能为系统性红斑狼疮，还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。需要检查的人群：患有以上病症者
注意事项
检查时要求：一般认为抗双链DNA的效价与病情相平行，即病情活动时，抗DNA抗体效价升高，病情缓解时，效价降低。由于各地测定的方法不同，所以正常值也不同，一般来说，结合率要大于20%以上才有临床意义。检测技术的特异性都不是100%的。例如，绿蝇短膜虫动基体中虽不含单链DNA（ssDNA），但可能含少量组蛋白，放免法、ELISA法、滴金渗滤法等用作抗原的dsDNA，也常常含有ssDNA，而即使污染的ssDNA不足1%，引起的假阳性即可高达6%。因此，对抗双链DNA的检测结果应结合临床分析，必要时应动态观察。此外，鉴于检测试剂中DNA抗原的来源不同，碱基组成和顺序可能有一定差异，使抗体结合的表位发生变化。
检查方法
测定抗双链DNA的方法有多种，如免疫扩散、对流免疫电泳、凝集试验、科体结合试验、间接免疫荧光法、放射免疫分析、酶联免疫吸附法等。最常用的是放射免疫分析、间接免疫荧光和酶联免疫吸附法。