呼吸内窥镜技术是以内窥镜为基础，结合电脑监控，对呼吸系统进行检测的方法。主要包括支气管镜、胸腔镜和纵隔镜，分别用于气管/支气管、胸膜腔和纵隔的直视检及和标本获取。
支气管镜
主要用于气管、支气管和肺部疾病的诊断和治疗。可用于肺部感染患者病原学的检查、可疑肿瘤患者的诊断、帮助咯血患者确定出血的病因及出血部位、局部止血、解除呼吸道梗阻、分泌物引流、异物取出等。该方法较为安全有效，并发症发生率约0.1%～0.25%，死亡率约0.01%～0.025%。常见的并发症有术后发热、出血、低氧血症、支气管痉挛、气胸、心律失常、心脏骤停等。
胸腔镜
主要用于胸膜疾病的诊断和治疗。常用于恶性胸腔积液的诊断和治疗、恶性间皮瘤的诊断和治疗、顽固性气胸的治疗、弥漫性肺间质疾病的肺活检检查。其中胸腔镜下滑石粉喷洒是胸膜腔闭锁的一种非常有效的方法。
纵隔镜
主要用于纵隔、肺门病变的诊断，尤其是恶性病变。该操作需在全麻下进行，于胸骨切迹上、甲状腺峡部下方、双侧胸锁乳突肌间做横切口，分离至隆突处，先用手指触诊，再插入纵隔镜观察和取活检。可用于纵隔、肺门占位性病变的诊断，作为手术切除或放化疗的组织学根据。也可用于切断右侧迷走神经以解除晚期肺癌患者的疼痛。
呼吸内窥镜技术是一项重要的诊疗手段，但并发症和意外死亡亦可能发生，应严格掌握适应证，充分考虑风险-获益比。