用比较精细的龈下刮治器刮除位于牙周袋内根面上的牙石和菌斑的方法。
龈下刮治术是每一位牙周炎患者都需要经历的治疗，也是最重要的牙周治疗，因为引起牙周炎的致病菌位于牙周袋内，不清除龈下牙石和龈下菌斑将无法根本改善牙周炎症状况，炎症还会持续进展。龈下刮治术的主要目的是彻底清除牙龈下方的刺激因素，如菌斑、牙石、内毒素等，破坏龈下菌斑生物膜的结构，减少龈下微生物的数目，并改变龈下菌斑的构成，由以革兰阴性厌氧菌为主转变为以革兰阳性和兼性菌为主，形成与健康牙龈相一致的菌斑成分。伴随着这些微生物学的改变，临床上牙龈的炎症会减轻或消失。牙周的后续治疗，如咬合调整、牙周手术等都必须在这一阶段治疗的基础上进行。
龈下刮治术需用比较精细的龈下刮治器或超声洁牙机的精细工作头刮除位于牙周袋内根面上的牙石、附着菌斑和非附着菌斑。在做龈下刮治时，必须同时刮除牙根表面感染的病变牙骨质，并使部分嵌入牙骨质内的牙石和毒素也能得以清除，使刮治后的根面相对光滑而平整，具有生物相容性的表面，有利于牙周组织的附着和新生，称之为根面平整术。龈下刮治和根面平整虽从概念上有所差异，有两个步骤，但在临床上很难区分。治疗时选择细而长的工作头，以便于深入牙周袋内（特别是根分叉区或根面的凹陷区）进行工作，减少对软组织的损伤。21世纪初新型的龈下喷砂抛光材料（甘氨酸、赤藓糖醇）问世，使用龈下喷砂清除龈下菌斑的效率更高，菌斑去除得更加彻底，而且节省治疗时间。
牙本质敏感是一些患者在牙周洁治术或刮治术后常见的并发症。一般情况下，牙本质在冠部由釉质覆盖，在根面由牙骨质覆盖。当釉质或牙骨质丧失，牙本质暴露（图2可见牙根暴露），牙本质小管可以直接将外界的冷热、触觉等刺激传递到牙髓，从而引起敏感。运用机械手段去除牙石等刺激因素，不可避免地导致部分牙骨质甚至牙本质丢失，特别是超声工作尖在脱矿牙面，例如一些早期龋、釉质发育不良等，会引起患者敏感症状，以牙颈部更为明显。牙本质敏感症状一般数日即可消失，如持续发生，可用激光或脱敏材料进行脱敏处理。