为了预防传染病的传入、传出和传播所采取的综合措施。包括医学检查、卫生检查和必要的卫生处理。早在14世纪，鼠疫在亚洲流行并通过商船往来传入欧洲。意大利首先实行检疫，以防止鼠疫传入。检疫一词来自意大利语“quarantina”，为“40”之意，即外来商船须在海港外停留40天。此期间不发生鼠疫，商船才能入港。之所以要观察40天，据说是纪念基督在沙漠中与世隔绝地经受了40天试炼。有动物检疫及植物检疫。与人体健康有关的检疫主要包括国境卫生检疫和疫区检疫及地区间交通卫生检疫。这三种卫生检疫称谓不同，但有紧密的相关性。
国境卫生检疫
这是预防传染病由国外传入国内或由国内传出国外的重要措施。每个国家都按自己的需要规定了需要检疫的病种，例如1986年12月2日通过的《中华人民共和国国境卫生检疫法》规定检疫的传染病有鼠疫、霍乱、黄热病以及国务院公布的其他传染病，并在国境处（如国际通航的港口、机场以及陆地入境处和国界江河的口岸）设立国境卫生检疫站，配备专业医务人员代表国家执行检疫任务，对发病者、可疑患者及密切接触者都要进行隔离或留检。需要检疫的病种可根据具体情况随时调整。如天花原来是各国均要进行检疫的病种，但由于天花已在全世界消灭，故这一病种已无检疫的必要，种痘证明也随之取消。若入境的交通工具来自检疫传染病疫区，被检疫传染病污染，或其中发现能引起传染病的啮齿动物或病媒昆虫时，应进行消毒灭鼠、除虫及其他卫生处理。
疫区检疫及地区间交通卫生检疫
当国内发生烈性传染病，如鼠疫、霍乱时可进行这种检疫，以防止疾病扩散。这种检疫的原则是：
①限制疫区和非疫区之间的交往（交通检疫）。疫区人员原则上不离开疫区，必须离开时，到非疫区后应按该病的接触者处理。对该病无免疫力的非疫区人员也禁止进入疫区。
②搜索疫区内的全部传染源（包括患者、病原体携带者等）加以隔离、治疗。
③疫区内进行消毒、灭虫或杀灭保菌动物。
④接触者进行适当处理，对易感者接种疫苗或用药物预防。
实施各种预防措施后，到最后一个病例的接触者的最长潜伏期，仍未再发生新的病例，疫区的检疫才告终结，如鼠疫疫区的检疫期，是从发现首例鼠疫患者起，到最后一个鼠疫接触者接触后9天止。