由各种脑部病变或躯体疾病所引起的精神障碍，可分为脑器质性精神障碍和躯体疾病所致精神障碍两类。
脑器质性精神障碍是指由于脑变性疾病、脑血管疾病、颅内的各种感染、脑部的外伤、脑部的各种肿瘤、癫痫等所致精神障碍的总称。躯体疾病所致精神障碍是指除大脑以外的躯体疾病伴发的精神障碍等的总称，躯体疾病包括躯体感染、内脏器官的各种病变、内分泌代谢系统疾病、结缔组织疾病等。
器质性精神障碍的临床表现没有特异性，与功能性精神障碍类似，常引起误诊。慢性起病或疾病的早期往往表现为脑衰弱综合征，急性起病或病情严重者往往引起脑部的病变，表现为急性脑病综合征或慢性脑病综合征等。
脑衰弱综合征
是指发生于器质性疾病时的类神经衰弱症状，早期表现为头痛、头胀、乏力、失眠、注意力集中困难、健忘、关节酸痛、敏感、焦虑、易疲劳、多梦以及情绪不稳或失禁等，同时伴发多汗，心率增快等自主神经功能紊乱症状。病程缓慢，症状常有波动，下午或晚上较重，经过适当休息可减轻，也可有程度不等的间歇期。体检和实验室检查可以发现器质性病变的基础。多见于脑动脉硬化、脑外伤、脑炎早期、帕金森病早期、库欣病、中毒、烟酸缺乏、慢性心脏病、严重贫血、慢性感染、肾功能衰竭、甲状腺功能减退等。
诊断及鉴别诊断：诊断要点包括明显和持续的情绪不稳定或失禁；容易疲劳；一系列不愉快的躯体感受和疼痛；波动性病程，缓慢进展；有器质性病变的证据。本病与神经衰弱具有类似的临床表现，但本病有明确的器质性病变基础，故可以鉴别。
幻觉妄想综合征
在器质性病变基础上所产生的以幻觉妄想为主的精神病性障碍，器质性幻觉症常伴继发性的妄想，故《精神障碍诊断与统计手册》第五版（DSM-5）将器质性幻觉症和器质性妄想症合称为器质性精神病性障碍。本综合征可出现各种感官的幻觉，常见幻视、幻听、幻嗅、幻味、幻触等，幻觉的内容可以是要素性的，也可以是情景性的，幻觉内容与致病因素、患者所处的环境、中枢神经系统病损的性质、范围、部位等因素有关。妄想可以单独出现，也可在幻觉的基础上产生，妄想内容多样，可表现为关系妄想、被害妄想、物理影响妄想等。幻觉和妄想往往相互依存，互相影响。
常见病因包括慢性酒中毒、肿瘤、感染、脑血管病、癫痫、甲状腺和肾上腺疾病、代谢疾病、肝肾疾病、自身免疫系统疾病等。颞叶癫痫患者往往表现为幻嗅觉，闻到令人不愉快的气味或烧焦橡皮的味道。酒精中毒性幻觉以听幻觉多见，可为评论性或命令性，或辱骂恐吓或评论配偶不忠，引起相应的情感和行为反应。
诊断：详细的病史、体格检查、实验室检查和精神检查，有助于诊断。
治疗原则：首先，积极治疗器质性疾病；其次，针对患者的幻觉妄想使用抗精神病药物，药物起始剂量要小，加药要缓慢，直至达到最小的有效剂量。
急性脑病综合征
又称谵妄，是一组表现为急性、一过性、广泛性的认知障碍，尤以意识障碍为主要特征。具有起病急、病程短、病情发展迅速的特点，若不及时处理，则可出现昏迷，乃至死亡。躯体感染、水电解质平衡紊乱、药物过量或中毒等是其最常见的发病原因，但发病机制迄今未明。急性脑病综合征是综合性医院，尤其是急诊室最常见的精神障碍之一，也是综合性医院精神科会诊最常见的病种之一。
急性脑病综合征主要表现为不同程度的意识障碍、定向障碍、记忆障碍、睡眠-觉醒障碍、感知觉障碍、思维障碍等。意识障碍表现为意识模糊、嗜睡或昏睡，注意力集中困难，对周围环境与事物的觉察能力降低，具有昼轻夜重的特点。定向障碍主要表现为对时间和地点的定向障碍，严重的患者也会出现人物的定向障碍。记忆障碍以即刻记忆和近记忆障碍最为明显，患者对新近发生的事件难以识记，好转后患者对谵妄状态时的表现或发生的事大部分遗忘。睡眠-觉醒周期障碍主要表现为睡眠节律紊乱，白天嗜睡而晚上清醒。感知觉障碍常表现为感觉的过敏，患者对声和光敏感，错视和幻视极为常见，患者可因错觉和幻觉产生继发性的片段妄想、冲动行为。情绪障碍非常突出，包括恐怖、焦虑、抑郁、愤怒或者欣快等。谵妄通常急性起病，症状波动性大，通常持续数小时或数天，老年患者可持续数月。
对于谵妄的治疗主要包括病因治疗、支持治疗和对症治疗。病因治疗是指针对脑或躯体疾病的治疗。支持治疗包括补充营养、维持水电解质及代谢的平衡。同时限制患者白天的睡眠时间，保持昼夜节律，白天尽量自然光，晚上柔和的人工光线来减少患者错觉或幻觉，同时尽量为患者提供一个舒适、安静的环境，加强对谵妄患者的看护，防止伤人或自伤行为的发生。对症治疗是指针对患者的精神症状的治疗，对于严重的精神症状应尽量给予小剂量的抗精神病药物，如氟哌啶醇、利培酮、奥氮平以及喹硫平等。苯二氮䓬类药物可加重意识障碍、认知损害和抑制呼吸，一般情况下不建议使用。但对于酒精等戒断反应引起的谵妄可以使用小剂量的苯二氮䓬类药物。
遗忘综合征
又称柯萨可夫综合征。是由脑部器质性病理改变所导致的一种选择性或局灶性的认知功能障碍，以近事记忆障碍为主要特点，患者意识清晰，没有智能障碍。
引起遗忘综合征的最常见原因是酒精滥用所导致的维生素B1缺乏，另外如心脏停搏所致的缺氧、一氧化碳中毒、心脑血管性疾病、脑部炎症、第三脑室部位的肿瘤等也可导致遗忘综合征的发生。
遗忘综合征最主要临床表现是严重的记忆障碍，特别是近事记忆障碍，注意力和即刻回忆基本正常。患者学习新鲜事物非常困难，无法记住新近发生的事情，患者为了弥补这些缺陷，常进行错构或虚构，将毫无关联的事件、人物、地点进行张冠李戴，缺乏逻辑性。严重记忆障碍的患者常伴有定向障碍，时间、地点定向受损最常见，而自我定向常常保存。患者学习能力下降，记忆能力受损，明显影响社交和职业功能。
治疗主要是针对病因治疗，如酒精依赖所致者需戒酒，硫胺缺乏者补充维生素B1；如系血管病变或颅内肿瘤所致，则以治疗原发病为主。本病已发生大脑局灶性器质性病理改变，尽管发现与治疗及时，预后仍欠佳。
慢性脑病综合征
即痴呆，是指严重、持续的认知功能障碍。在意识清晰的情况下，患者逐渐出现越来越重的智能障碍，伴有不同程度的人格改变。
引起痴呆的病因种类繁多，包括中枢神经变性疾病、脑血管疾病、颅内占位性的病变、各种中毒感染、脑部外伤和代谢的紊乱等，但能有效治疗的病因并不多见。如能及时发现、及早治疗，部分痴呆患者预后相对较好，10%～15%的患者在针对病因的治疗后可以获得部分程度的改善，包括由内分泌障碍、神经梅毒以及部分颅内占位性病变等所致的痴呆。
痴呆的发生发展缓慢隐匿，近事记忆障碍常常是最早症状，患者学习新事物的能力明显减退，随着病情的进一步发展，远记忆也受损，到后期患者因为记忆障碍常常出现继发性的被窃妄想。患者的思维贫乏、联想速度减慢，抽象思维及概括能力明显下降，对一般事物的理解力和判断力越来越差，注意力受损，可出现计算困难或者不能计算简单的数学题目。随病情进展患者时间﹑地点和人物均定向障碍。患者可出现人格改变，变得不爱整洁、不修边幅、暴躁易怒、敏感多疑。社会功能受损，对自己熟悉的工作不能完成。晚期生活不能自理，运动功能逐渐丧失，甚至穿衣﹑洗澡、进食以及大小便均需他人协助。最后常因褥疮、骨折、肺炎、营养不良等继发躯体疾病而死亡。
首先，应及早治疗病因。其次，需评估患者认知功能和社会功能损害的程度，以及精神症状、行为问题和患者的家庭与社区资源等。制订个体化的治疗方案，因为尚缺乏治疗认知功能障碍的特效益智药物，因此治疗的目的是提高患者的生活质量，减轻患者给家庭带来的负担。抗精神病药物可用于控制精神病性症状、激越行为或攻击行为。抗抑郁药可用于痴呆伴抑郁的患者，有助于改善痴呆综合征。由于老年人对抗精神病药物的不良反应更为敏感，故应从小剂量开始，缓慢加量，症状改善后需逐渐减量或停止用药。第三，需注意加强痴呆晚期患者护理工作。