呈正中矢状位的两侧间脑之间的稍宽的垂直裂隙。
脑室系统的一部分，其前部以室间孔与左右侧脑室相通，向后经中脑水管与第四脑室相通。可分为上（顶）、下（底）、前、后和两个侧壁，见图。
上壁
由脑室膜及软脑膜连合而成，长于两侧丘脑髓纹之间，呈凸向上方的弧形。此处软脑膜实属两层，上层贴附在胼胝体和穹隆的下面，下层黏附在第三脑室的室管膜和丘脑后部的上面。横裂中的软脑膜形成皱襞，成为第三脑室脉络膜组织。此处脉络组织的内面有两条前后纵行的血管丛，顶着室管膜突入第三脑室，形成第三脑室脉络丛，分列于中线两侧，前端在本侧脑室孔处与本侧侧脑室脉络丛相连，后端至松果体上方。
下壁
主要由丘脑下部构成。从后上斜向前下，自后向前分别由后穿质、乳头体、灰结节、漏斗和视交叉构成。下壁由两个隐窝，前上方为视隐窝，突向终板与视交叉之间；后下方是漏斗隐窝，深入垂体漏斗，适在蝶鞍上方。
前壁
上部由前连合和穹隆柱构成，下部由终板构成。前连合是一横贯终板上端的古老连合纤维束，再向上与胼胝体的嘴板向移行，移行部的后方为穹隆柱。穹隆柱的后方有一孔，即室间孔，孔的后界是丘脑前结节。终板来自原始神经管的嘴侧端，为一薄层灰质，实属端脑。前壁在室间孔的前方与顶壁相接，在视交叉的上方与底壁相接。后者形成一个三角形隐窝，称为视隐窝。
后壁
自上而下依次由缰连合、松果体、后连合、大脑脚的前端构成，此处再向下移行于底壁的上端-后穿质。室腔突入松果体柄内，形成松果体隐窝，在松果体的上方还有一隐窝，称为松果体上隐窝。
侧壁
两个侧壁上部由背侧丘脑内侧面构成，下部由丘脑下部和丘脑底部构成，两者之间以丘脑下沟为界，背侧丘脑约占2/3，丘脑下部及丘脑底部约占1/3。丘脑下沟前起室间孔，行向后下延入中脑水管。侧壁的上界为丘脑髓纹。两侧背侧丘脑之间由丘脑间黏合相连，不过约有30%的人缺如。